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アイテム
Real-time MBDi-RPA using methyl-CpG binding protein 2: A real-time detection method for simple and rapid estimation of CpG methylation status
http://hdl.handle.net/10129/0002000731
http://hdl.handle.net/10129/00020007317cc5b112-3633-4ea1-bb61-f6008b871e49
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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本文 (1.2 MB)
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.png)
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内容要旨 (246 KB)
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審査要旨 (179 KB)
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| Item type | リポジトリ登録用アイテムタイプ（シンプル）(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2025-01-09 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | Real-time MBDi-RPA using methyl-CpG binding protein 2: A real-time detection method for simple and rapid estimation of CpG methylation status | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | eng | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | CpG | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | MBD | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | MeCP2 | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | RPA | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | MBDi-RPA | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||||
| 資源タイプ | doctoral thesis | |||||||
| アクセス権 | ||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||
| 著者 |
石戸谷, 美奈
× 石戸谷, 美奈
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| 抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||
| 内容記述 | Background Analysis of CpG methylation is informative for cancer diagnosis. Previously, we developed a novel method to discriminate CpG methylation status in target DNA by blocking recombinase polymerase amplification (RPA), an isothermal DNA amplification technique, using methyl-CpG binding domain (MBD) protein 2 (MBD2). The method was named MBD protein interference-RPA (MBDi-RPA). In this study, MBDi-RPA was performed using methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2), another MBD family protein, as the blocking agent. Results MBDi-RPA using MeCP2 detected low levels of CpG methylation, showing that it had higher sensitivity than MBDi-RPA using MBD2. We also developed real-time RPA, which enabled rapid analysis of DNA amplification without the need for laborious agarose gel electrophoresis and used it in combination with MBDi-RPA. We termed this method real-time MBDi-RPA. The method using MeCP2 could determine the abundance ratio of CpG-methylated target DNA simply and rapidly, although highly sensitive detection was challenging. Significance and Novelty Real-time MBDi-RPA using MeCP2 could be potentially useful for estimating CpG methylation status in target DNA prior to more detailed analyses. |
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| 言語 | en | |||||||
| 内容記述 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Author: Mina Ishidoya, Toshitsugu Fujita, Sadatomo Tasaka, Hodaka Fujii | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 内容記述 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Citation: Analytica Chimica Acta, 1302:342486, 2024 May 8 | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 書誌情報 |
en : Analytica Chimica Acta 巻 1302, p. 342486, 発行日 2024-05-08 |
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| ISSN | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||
| 収録物識別子 | 1873-4324 | |||||||
| DOI | ||||||||
| 関連タイプ | isVersionOf | |||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||
| 関連識別子 | 10.1016/j.aca.2024.342486 | |||||||
| 権利情報 | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 権利情報 | © 2024 Elsevier B.V. All rights reserved | |||||||
| 出版タイプ | ||||||||
| 出版タイプ | AM | |||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||||
| 出版者 | ||||||||
| 出版者 | Elsevier B.V. | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 学位名 | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 学位名 | 博士（医学） | |||||||
| 学位授与機関 | ||||||||
| 学位授与機関識別子Scheme | kakenhi | |||||||
| 学位授与機関識別子 | 11101 | |||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 学位授与機関名 | 弘前大学 | |||||||
| 学位授与年月日 | ||||||||
| 学位授与年月日 | 2024-09-30 | |||||||
| 学位授与番号 | ||||||||
| 学位授与番号 | 甲第2301号 | |||||||
