WEKO3
アイテム
Genetic analyses of the fusion protein genes in human parainfluenza virus types 1 and 3 among patients with acute respiratory infections in Eastern Japan from 2011 to 2015
http://hdl.handle.net/10129/6122
http://hdl.handle.net/10129/61227a62c5d6-c578-4209-ba9f-2940a759b0bb
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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審査要旨 (78.7 kB)
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論文要旨 (280.4 kB)
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本文 (935.7 kB)
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| Item type | 学位論文 / Thesis or Dissertation(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2017-07-14 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | Genetic analyses of the fusion protein genes in human parainfluenza virus types 1 and 3 among patients with acute respiratory infections in Eastern Japan from 2011 to 2015 | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | eng | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||||
| 資源タイプ | doctoral thesis | |||||||
| アクセス権 | ||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||
| 著者 |
筒井, 理華
× 筒井, 理華
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| 著者(ヨミ) | ||||||||
| 識別子Scheme | WEKO | |||||||
| 識別子 | 16312 | |||||||
| 姓名 | ツツイ, リカ | |||||||
| 著者別名 | ||||||||
| 識別子Scheme | WEKO | |||||||
| 識別子 | 16313 | |||||||
| 姓名 | Tsutsui, rika | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 値 | 弘前大学大学院保健学研究科 | |||||||
| 抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||
| 内容記述 | 2011年から2015年にかけて、東日本における急性呼吸器感染症（ARI）患者から検出されたヒトパラインフルエンザウイルス1型（HPIV1,1668nt）および3型（HPIV3,1620nt）の融合タンパク質遺伝子（F遺伝子）の全長を解析した。最尤法を用いて系統樹を構築し、遺伝的距離（p-distance）およびpositive selection site および negative selection sites を解析した。プロトタイプ株におけるタンパク質の線状エピトープも予測した。さらに、本株のタンパク質のアミノ酸置換をマッピングした。HPIV1は2つのクラスター、HPIV3は1つのクラスターに分類された。 HPIV1およびHPIV3 F遺伝子のp-距離値は<0.03であった。HPIV1 は2つのpositive selection sitesを、HPIV3は1つのpositive selection sitesを検出した。また、両方の株について、 10以上のnegative selection sitesを明らかにした。HPIV1のプロトタイプ株は4つのエピトープ、HPIV3のプロトタイプ株は5つのエピトープが予測された。HPIV3で予測されたエピトープはpositive selection site（aa108）に関与していた。さらに、LC76627株におけるアミノ酸置換（R73K）はHPIV3の1株のみで検出され（LC76627）、モノクローナル抗体による中和に対する耐性に影響を及ぼすことが考えられた。これらの結果は、調査期間中の東日本において、HPIV1およびHPIV3のF遺伝子が比較的よく保存されていることを示唆している。 | |||||||
| 書誌情報 | 発行日 2017-03-23 | |||||||
| 著者版フラグ | ||||||||
| 出版タイプ | ETD | |||||||
| その他のタイトル | ||||||||
| その他のタイトル | 2011年から2015年の東日本における急性呼吸器感染症患者のヒトパラインフルエンザウイルス1型および3型の融合タンパク質遺伝子の遺伝学解析 | |||||||
| タイトル（ヨミ） | ||||||||
| その他のタイトル | Genetic analyses of the fusion protein genes in human parainfluenza virus types 1 and 3 among patients with acute respiratory infections in Eastern Japan from 2011 to 2015 | |||||||
| NIIサブジェクト | ||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | 医学 | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 値 | Thesis | |||||||
| 学位名 | ||||||||
| 学位名 | 博士（保健学） | |||||||
| 学位授与機関 | ||||||||
| 学位授与機関名 | 弘前大学 | |||||||
| 学位授与年月日 | ||||||||
| 学位授与年月日 | 2017-03-23 | |||||||
| 学位授与番号 | ||||||||
| 学位授与番号 | 甲068 | |||||||
